在分子生物学实验、基因克隆、蛋白表达及生物制造领域,大肠杆菌凭借其繁殖迅速、培养成本低廉、基因操作简便等优势,成为应用最广泛的模式微生物。其中,K-12株系因基因组清晰、遗传背景明确,衍生出多种常用菌株,其基因型的细微差异的决定了菌株的功能特性与适用场景。
常用大肠杆菌菌株主要分为三大类:K-12株系、B株系及C株系,其中K-12株系是分子克隆、质粒构建的主流选;B株系(如BL21 (DE3))侧重蛋白表达,C株系(如C-la)为野生型菌株,应用相对小众。菌株的基因型是其遗传特性的核心体现,标注遵循统一规范,结合表格中菌株信息,核心规则如下:
基因标注以三字母斜体缩写为主(如supE、hsdR),代表特定功能基因,若功能不同的同源基因,需加大写字母区分(如recA、recB);
缺失型基因标注“Δ”符号,若缺失片段含多个基因,用括号标注完整区间(如Δ(lac-proAB),表示缺失lac至proAB区间基因);
质粒或噬菌体携带的基因,用“/”与菌株自身基因型连接(如BB4菌株的ΔJacUJ169/F [proAB*, lac, lacZ△M15Tn10 (tet')],表示含F质粒及相关基因);
抗性基因及突变类型标注清晰,如tet'表示四环素抗性、Rif'表示利福平抗性,插入突变用“::”标注(如mutS215::Tn10,表示Tn10转座子插入mutS基因);
野生型菌株直接标注菌株类型(如C-la菌株标注“A wild type strain (C strain)”),无复杂基因缺失或突变。
常用大肠杆菌(K-12株来源)基因型如下:
关键注意事项注意菌株来源差异:K-12株系侧重克隆与质粒构建,B株系(BL21 (DE3))侧重蛋白表达,不可混淆使用,如用BL21 (DE3)进行复杂质粒构建,易导致质粒不稳定;
关注基因型细节:部分菌株基因型高度相似(如DH1与DH5),功能一致可互换使用;部分菌株仅存在细微差异(如K802与K803),根据实验精度灵活选择;
规避原文笔误:如Y-1090菌株的ΔpacU169应为ΔlacU169,实验中可按ΔlacU169解读其功能,避免因笔误影响实验设计;
重视抗性标记:菌株的抗性基因(如tet'、Rif')可作为筛选标记,实验中需匹配对应的抗生素,避免筛选失败;
规范菌株保存与传代:常用菌株多为基因缺陷型,传代过程中易丢失关键基因型,需低温保存,减少传代次数,确保菌株特性稳定。
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