在核酸电泳实验中,Agarose(琼脂糖)凝胶是分离、鉴定DNA/RNA的核心载体,被誉为“核酸电泳标尺”。它通过形成多孔网状结构,依据核酸分子量大小实现精准分离,广泛适配质粒鉴定、基因组DNA片段分离、PCR产物检测等分子生物学实验场景。其配制质量、浓度选择直接决定电泳条带清晰度与分离效果,是核酸实验中不可或缺的关键操作环节。
Agarose凝胶的核心分离原理简洁明确:琼脂糖粉末经加热熔化后,冷却凝固形成三维多孔网状结构,孔径大小与琼脂糖浓度负相关——浓度越低,孔径越大,适合分离大分子核酸;浓度越高,孔径越小,适合分离小分子核酸。实验中可根据目标核酸的分子量,选择适配浓度的琼脂糖,实现高效分离与精准鉴定,同时需严格遵循配制规范,避免影响电泳效果。
以下是Agarose凝胶的配制:
1. 缓冲液统一:用于电泳的缓冲液与用于制胶的缓冲液必须完全一致,避免因缓冲体系差异导致核酸迁移异常、条带偏移,影响实验结果。
2. 溴乙锭防护:溴乙锭具有强致癌性,配制、使用含溴乙锭的溶液时,必须全程佩戴丁腈手套、实验服,严禁皮肤直接接触;实验结束后,废弃的含溴乙锭溶液及凝胶需按有害废弃物规范处理,不可随意丢弃。
3. 加热规范:加热熔化琼脂糖时,严格控制加热时间,避免暴沸;摇动锥形瓶时需戴防热手套,防止烫伤;未完全熔化的琼脂糖需重新加热,确保无残留颗粒。
4. 凝胶保存:凝胶不立即使用时,用保鲜膜密封好制胶模,置于4℃冰箱保存,一般可稳定保存2~5天;保存期间避免挤压、碰撞凝胶,防止凝胶破损或污染。
5. 浓度选择:根据目标线形DNA的分子量,参考浓度-分辨范围表选择适配浓度,避免浓度过高导致小分子核酸迁移过慢、条带压缩,或浓度过低导致大分子核酸分离不彻底。
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