在核酸杂交实验中,Salmon DNA(鲑鱼精DNA)是核心的非特异性结合阻断试剂,被誉为“核酸杂交阻断剂”。其核心作用是封闭杂交体系中的非特异性结合位点,减少探针与非目标核酸的非特异性结合,降低实验背景,显著提升核酸杂交的特异性与灵敏度,广泛适配Southern blot、Northern blot、原位杂交等各类核酸杂交实验场景。其配制质量、纯度及处理方式,直接决定杂交实验的成败,是分子生物学实验中核酸杂交相关研究的必备试剂。
Salmon DNA之所以能作为理想的阻断试剂,核心优势在于其来源广泛、纯度易控制,且与大多数物种的核酸序列无特异性同源性,不会与目标核酸探针发生特异性结合。实验中,Salmon DNA经变性处理后,可优先结合杂交膜、载玻片或反应体系中的空白核酸结合位点,形成“保护膜”,从而阻止探针非特异性吸附,避免假阳性信号产生,同时不影响探针与目标核酸的特异性杂交反应,为实验结果的准确性提供保障。
10 mg/ml Salmon DNA(约100 ml 装)精准配方如下:
10 mgml Salmon DNA(约100 ml 装)精准配方.pdf
1. 核酸酶防护:Salmon DNA易被核酸酶降解,所有与DNA接触的实验用品(烧杯、移液管、离心管等)需提前高压灭菌,避免核酸酶污染;配制过程中全程保持无菌操作,防止微生物滋生产生核酸酶。
2. 分装保存规范:长期反复冻融会导致DNA断裂或降解,严重影响阻断效果,因此配制完成后务必小份分装(1 ml/份),-20℃密封保存;取用后立即放回冰箱,避免室温放置过久,严禁反复冻融同一份溶液。
3. 溶解与纯化要求:溶解Salmon DNA时,需用TE Buffer,室温搅拌足够时间(2~4小时),确保完全溶解;若溶液始终浑浊,说明含有杂质或未完全溶解,可延长搅拌时间,或在低于60℃的条件下温和加热辅助溶解,溶解完成后务必过滤去除杂质,避免影响DNA纯度。
4. 抽提操作规范:苯酚、苯酚/氯仿具有腐蚀性和毒性,抽提过程中需佩戴手套、护目镜,在通风橱内操作;颠倒混匀时动作要轻柔,避免剧烈摇晃导致DNA断裂,同时确保充分分层,准确收集水相DNA溶液,避免混入有机相杂质。
5. 使用前变性处理:Salmon DNA需经变性(沸水浴加热+快速冰浴)形成单链后,才能发挥阻断作用,未变性的双链DNA阻断效果极差;变性后需立即使用,避免单链DNA复性,影响实验效果。
6. 浓度精准控制:最终DNA浓度需精准调节至10 mg/ml,浓度过高会导致杂交背景偏高,浓度过低则无法有效封闭非特异性位点;测定OD260值时,需将DNA溶液适当稀释,确保OD值在0.1~1.0之间,提高浓度计算的准确性。
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