核酸DNA Marker全攻略：原理、选择与应用指南

1引言

在分子生物学实验中，核酸DNA Marker是核酸凝胶电泳的一把“标尺”，本质是一系列已知大小DNA片段，用作估算目标片段大小的参照物。无论是PCR产物或酶切产物验证，还是质粒构建，DNA Marker都在其中扮演着至关重要的角色。然而，面对各种各样的DNA Marker，如何根据实验需求正确选择和使用，往往让许多人感到疑惑。本文将系统阐述核酸DNA Marker的分类、原理、选择及使用，帮助更多实验者轻松运用这一基础实验工具。

2核酸DNA Marker的分类

2.1 按分子量范围分类

表2-1 DNA Marker的分类

2.2 按产品形式分类

l 即用型Marker：已含1×Loading Buffer，可直接上样电泳^[1]

l 浓缩型Marker：需添加Loading Buffer后使用

3核酸DNA Marker的工作原理

DNA Marker的核心原理基于核酸凝胶电泳。DNA骨架^[2]携带磷酸基团呈负电性，电场作用下向正极移动；在琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶中，DNA片段的迁移率与其分子量的对数成反比^[3]：分子量越小，迁移越快；分子量越大，迁移越慢。因此，当DNA Marker 与待测样品经电泳分离后，通过对比样DNA Marker条带与样品条带的迁移位置，即可推算样品DNA的片段大小。

4 核酸DNA Marker的选择

4.1 根据目标片段大小

选择DNA Marker时，首要原则是使目标片段落在Marker的线性范围内。例如^[4]，目标片段约为500 bp，可选择100 bp DNA Ladder；目标片段约为5 kb，则可选择1 kb DNA Ladder。

4.2 根据实验目的选择

PCR产物鉴定：通常选用100 bp或200 bp DNA Ladder。

酶切产物鉴定：可选用1 kb DNA Ladder或更宽范围的Marker。

定量：如需对DNA样品进行浓度估算，可选用含有已知浓度的DNA Marker。

4.3 根据凝胶类型

不同类型凝胶对Marker的分辨能力不同。琼脂糖凝胶电泳适用于100 bp以上的DNA片段分离，而聚丙烯酰胺凝胶电泳具有更高的分辨率，适用于100 bp以下的小片段DNA分析。

5 核酸DNA Marker的使用

5.1 核酸DNA Marker的操作流程

表5-1 核酸DNA Marker的操作步骤

5.2 保存

DNA Marker应保存于–20℃环境，避免反复冻融。长期反复冻融可能导致DNA降解，建议使用时分装成小份，每次取用一管^[7]。

6 常见问题与解决方案

表6-1 条带问题

参考文献

[1] 上海西格生物技术有限公司. DNA Marker Ⅱ产品说明书[EB/OL]. 2025.

[2] 朱玉贤，李毅，郑晓峰，等.现代分子生物学(第5版)[M].北京：高等教育出版社，2019.

[3] Sambrook J, Russell D W. Molecular Cloning: A Laboratory Manual (4th ed)[M]. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press,2012.

[4] Thermo Fisher Scientific. DNA Ladder Selection Guide[EB/OL]. (2023-01-15).

[5] 王艳,李明.核酸凝胶电泳中常用染料的应用与比较[J].生物技术通报,2020,36(5):245-250.

[6] 北京博迈德基因技术有限公司. DNA Marker使用常见问题及解决方案[EB/OL].

[7] Takara Bio Inc. DNA Marker Product Manual[Z]. Shiga: Takara Bio Inc, 2022.

相关产品采购链接（咨询客服，留言富沃克，可获取优惠价格）：

10XTBE TBE缓冲液 采购链接：10XTBE TBE缓冲液 Tris-硼酸电泳缓冲液 5XTBE溶液 500mL FWKNE

qPCR Mix 采购链接：探针法 Probe qPCR Mix MultiPlus 定量PCR试剂 科研试剂 FWKNE

DNase I 试剂 采购链接：脱氧核糖核酸酶I /DNA酶/ DNase I 试剂200 U 去除DNA RNase Free

如有其他试剂需求可扫下方二维码联系（可免费领取试剂(包邮)）：

手机（同微信）：19850855600