1.简介
核酸凝胶电泳是分子生物学中用于分离、鉴定和定量核酸的经典技术。在电泳操作中,上样缓冲液会直接影响样品沉降效果、电泳进程观察与条带质量。10× Loading buffer[1]由溴酚蓝、二甲苯氰、甘油、EDTA组分构成,是一种10倍浓缩核酸凝胶电泳上样缓冲液,适用于琼脂糖凝胶电泳和非变性丙烯酰胺凝胶电泳。使用时将其与样品充分混匀并稀释至1×浓度,溶液比重仍然较大,上样时易沉入点样孔,且呈现出清晰的蓝色指示条带,便于观察样品上样效果与电泳进程,显著提升了实验操作的便捷性与准确性。
2.功能和作用原理
2.1指示上样和电泳进程
10× Loading buffer含有溴酚蓝和二甲苯氰两种蓝色染料。溴酚蓝和二苯甲氰能指示样品是否充分沉入加样孔,以及显示核酸电泳迁移进程,以便判断电泳进度,适时终止电泳。溴酚蓝是一种pH指示剂,在常规电泳的碱性凝胶环境下,可维持稳定的蓝色。在0.5% - 5% 的琼脂糖凝胶中,它的迁移位置大致于[2]12bp-1150bp;在非变性丙烯酰胺凝胶中,它的迁移位置大致于12bp-100bp。因此常被用于电泳指示染料。
二甲苯氰通常呈现蓝色,在电泳过程中颜色相对稳定;二甲苯氰的分子量比溴酚蓝大,迁移率比溴酚蓝慢[3],在0.5% - 5% 的琼脂糖凝胶中,它的迁移位置大致于105bp-16700bp;在非变性丙烯酰胺凝胶中,它的迁移位置大致于45bp-460bp。
2.2增加样品密度
甘油是10× Loading buffer的核心密度调节组分,可提高样品的密度,使样品上样后沉降至点样孔底部,有效防止样品在电泳缓冲液中扩散或飘出点样孔,从而保证电泳条带清晰和实验结果准确。
2.3维持核酸迁移与稳定
乙二胺四乙酸二钠盐(EDTA-2Na)是的化学式为C₁₀H₁₄N₂Na₂O₈,其分子结构中含有两个氮原子和四个氧原子,易与金属离子结合形成稳定六齿螯合剂,对重金属有很高的螯合效率[4]。因此在DNA和RNA的电泳缓冲液中,EDTA像一个“分子钳子”,能够牢牢抓住并结合溶液中的游离金属离子,当EDTA清除了这些辅助因子后,溶液中即使存在微量的核酸酶,也会因为“缺钙”而失去活性,无法降解核酸,从而保持核酸稳定。
3.配制方法
3.1配制10× Loading buffer各组分浓度[5]
表3-1 10× Loading buffer各组分浓度
成分 | 浓度 |
溴酚蓝(Bromophenol Blue) | 0.25% (W/V)
|
二甲苯氰(Xylene Cyanol FF) | 0.25% (W/V) |
甘油(Glycerol) | 50% (V/N)
|
EDTA | 10 mM
|
3.2配制步骤
取一支洁净的10 mL 离心管,准确量取200μL的0.5M EDTA(pH8.0)和称取25mg的溴酚蓝以及25mg的二甲苯氰加入10mL离心管中,再向离心管中加入约4mL的DEPC处理水后,置于涡旋混匀器充分振荡,直至完全溶解;加入5mL的甘油,充分混匀;用DEPC处理水定容至10mL,室温保存。
4.注意事项
(1) 10× Loading buffer为10倍浓缩液,使用前需用 DEPC 处理水稀释至1×工作浓度,与核酸样品充分混匀后再上样,避免直接上样影响电泳效果。
(2) 本试剂含甘油、溴酚蓝和二甲苯氰,需在室温条件下密封保存,避免高温、冷冻及阳光直射。
(3) 溴酚蓝、二甲苯氰为染料指示剂,操作时注意避免接触皮肤与黏膜,若不慎接触,需立即用清水冲洗。
(4) 试剂使用均需在无核酸污染的实验环境中进行,避免外源 DNA/RNA 交叉污染,保证核酸样品的纯度与电泳条带的准确性。
(5) 试剂为实验专用试剂,仅限实验室科研使用,不可用于临床诊断、食品检测等其他用途。
10X loading buffer配制方法-富沃克生物.pdf
参考文献:
[1] 碧云天生物技术-DNA/RNA Native Loading Buffer (10X)(10X DNA/RNA非变性上样缓冲液)(R0211-2ml)
[2] 核酸电泳工作流程-琼脂糖凝胶电泳步骤方法-赛默飞 | Thermo Fisher Scientific - CN
[3] 吴乃虎.琼脂糖凝胶电泳[J].遗传工程,1983,(01):54-59.
[4] 陆建平,马柳军,黄彦明,等.乙二胺四乙酸和聚环氧琥珀酸对污泥中铅的萃取研究[J].化工技术与开发,2010,39(02):34-36.
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