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辛辛苦苦配的PCR跑不出来?问题可能出在水上

发布时间:2026-07-16      点击次数:1

辛辛苦苦配的PCR跑不出来?问题可能出在水上

做过分子实验的同学都懂——引物对了、酶没问题、程序也没设错,可PCR就是扩不出来,条带模糊、空白对照出了阳性、重复性时好时坏。排查了一圈,最后发现是水出了问题。

实验室里的水看起来都一样透明,但纯度的差别可太大了。自来水里有离子、有机物、微生物;蒸馏水做普通化学实验还行;可到了PCR、酶切、RNA实验这种“高要求”场景,水里残留的微量离子或核酸酶足以让你的实验前功尽弃。那到底该用什么水?ddH₂O又是怎么来的?

一、ddH₂O是什么?

ddH₂O,全称double distilled water,中文叫双蒸水。说白了就是蒸馏了两次的水。

第一次蒸馏能去掉大部分无机盐和不挥发杂质,但水中的挥发性组分(比如氨、二氧化碳、有机物)还会跟着蒸汽跑进水里。再蒸一次,就能把这些残留的挥发性杂质进一步甩掉。两次蒸馏下来,水里的无机盐、有机物、微生物、可溶解气体和挥发性杂质含量都降到了极低的水平。

在实验室用水的纯度序列里,ddH₂O的纯度高于普通蒸馏水和纯水(RO水),其电导率通常低于一次蒸馏水。而经过离子交换等多步纯化的超纯水(25℃时电阻率18.2 MΩ·cm)纯度则高于ddH₂O。[1][2]

二、不同类型实验用水对比[3][4]

水质类型

制备方法

纯度特点

适用场景

自来水

直接取用

含大量离子、有机物、微生物

清洗、初洗

蒸馏水

一次蒸馏

去除大部分无机盐,但挥发性杂质仍残留

普通化学实验、玻璃器皿冲洗

双蒸水(ddH₂O)

两次蒸馏

离子、有机物、微生物含量极低

PCR、酶切、电泳缓冲液、DNA溶解与保存

DEPC处理水

ddH₂O + DEPC处理 + 高压灭菌

RNase/DNase活性

RNA实验、反转录、体外转录

超纯水

离子交换+反渗透+精纯化

纯度最高,电阻率18.2 MΩ·cm(25℃)

高灵敏度分析、精密仪器用水

注:RNA相关实验必须使用DEPC处理水(RNase-free ddH₂O),普通双蒸水不适合用于RNA实验。

三、ddH₂O怎么制备?

常规双蒸水制备步骤:

1. 一次蒸馏:将纯水或去离子水加入蒸馏装置,加热蒸馏,收集蒸馏出的冷凝水。建议弃去最初约10%-20%的馏出液,以去除挥发性杂质和系统残留物。

2. 二次蒸馏:将第一次收集的蒸馏水再次加入蒸馏装置,进行第二次蒸馏,同样建议弃去初馏液,收集中段馏分即得ddH₂O。

3. 灭菌(可选) :如需无菌水,可将ddH₂O装入耐高压容器,121℃高压灭菌15-20分钟。灭菌后的ddH₂O称为无菌双蒸水。

 

关于DEPC处理水

RNA实验需使用DEPC处理水(RNase-free ddH₂O),制备方法为:在ddH₂O中加入0.1%(体积比)DEPC(焦碳酸二乙酯) ,剧烈振荡后室温静置过夜(或数小时),再经121℃高压灭菌15-20分钟去除残留DEPC[3]。

关键提醒:

l DEPC为潜在致癌物,操作需在通风橱中进行并佩戴手套。

l 含有Tris的缓冲液不能用DEPC处理——DEPC会与Tris反应生成氨基甲酸酯。

l DEPC处理后必须彻底高压灭菌去除残留,否则残留物会抑制酶反应。

l 灭菌后的DEPC处理水建议分装保存,避免反复开启引入污染。

 

四、商业化便捷选择——杭州富沃克生物

实拍图.jpg 

自己制备ddH₂O虽然原理简单,但蒸馏设备贵、耗时长、水质稳定性难以保证。如果追求省心省力,可以直接选择成熟的商业化产品。

产品名称

规格

产品货号

ddH₂O

1ml/10ml/100ml

DDH606-01/02/03

杭州富沃克生物科技有限公司

官网链接:https://www.fwkbio.com/list_21/718.htmlhtml

邮箱:support@fwkbio.com

厂家联系微信号:19850855600

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参考文献

[1] 双蒸水[EB/OL]. 百度百科, 2025-09-18.

[2] 双蒸水(ddwater)[EB/OL]. 美仑生物. https://www.meilunbio.com(产品货号PWL070)

[3] DEPC水和DEPC处理水的区别[EB/OL]. 索莱宝生物, 2015-08-19.

[4] 实验用水有哪几种?有什么区别?[EB/OL]. AnyTesting, 2026-06-17.

 

 


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