跑完胶一看,Marker条带跟蚯蚓爬似的——你的“分子尺子”可能没选对
别焦虑。今天这篇把DNA Marker那点事儿掰开揉碎讲清楚。看完你至少能回答三个问题:它到底是什么?配方里有什么?怎么选、怎么用不翻车?
DNA Marker说白了就是一把已知刻度的尺子。
这把“尺子”的“刻度”就是一系列已知长度的DNA片段【7】——100 bp、250 bp、500 bp、750 bp、1000 bp、2000 bp……【1】【2】
制备方式主要有三种【7】:
1. 载体酶切法:用限制性内切酶切割已知序列的质粒或λDNA,得到一系列固定大小的片段【7】
2. PCR扩增法:设计多对引物,PCR扩增出不同长度的目标片段
3. 化学合成法:适用于特定片段的人工合成
市面上的DNA Marker配方大同小异,核心成分就这几样(数据来源于多家品牌产品说明书【1】【2】【3】【4】【5】【6】【8】):
成分 | 它在干嘛 | 常见浓度 |
Tris-HCl缓冲液 | 稳住pH(通常7.6~8.0),保护DNA不被降解 | 10 mM【1】【2】【4】 |
EDTA | 螯合金属离子,抑制核酸酶活性 | 10 mM(部分产品为8 mM)【4】【5】 |
甘油 | 增加密度,让样品沉到点样孔底部,防止飘出 | 10%(部分产品5%~8%)【4】【6】 |
示踪染料(溴酚蓝/二甲苯青/橙黄G) | 让你肉眼看见电泳跑到哪里了,方便及时关电泳 | 0.008%~0.033%【4】【6】 |
补充说明:不同品牌的配方存在细微差异——有的用溴酚蓝,有的用二甲苯青FF,有的两者都用,部分产品还使用橙黄G【6】。pH值从7.6到8.0不等【1】【2】。这些都是正常的产品差异,不影响核心功能。
① 上样量:一般每孔加3~5 μL即可【4】【5】,具体按每1 mm加样孔宽度加1 μL计算【1】。加多了条带过曝变胖,加少了看不清。
② 凝胶浓度:推荐1.0%~2.5%琼脂糖凝胶——片段越小(如100~600 bp),需要凝胶浓度越高(2.0%~2.5%)【8】;片段越大(如500~7000 bp),用较低浓度(1.0%)即可【7】。
③ 电泳条件:电压4~10 V/cm(指凝胶长度,单位厘米),时间20~30分钟(在凝胶长度5~7 cm条件下)【2】。跑太快条带会歪,跑太慢浪费时间。
重要提醒【1】【2】【4】:
1. 无需加热——直接化冻混匀即可上样
2. 及时更换电泳缓冲液——老化的缓冲液离子浓度降低、pH上升,缓冲能力减弱,条带会模糊
3. -20°C长期保存,建议分装保存,避免频繁反复冻融
坑① 用了过期的电泳缓冲液 ❌ → 缓冲能力下降,条带跑得歪歪扭扭。
坑② Marker反复冻融 ❌ → DNA可能降解,条带变淡甚至消失。建议分装后-20°C保存【2】。
坑③ 上样量过大 ❌ → 条带过曝、变胖,无法准确判断大小【1】。
坑④ 凝胶浓度选错 ❌ → 小片段用低浓度胶会跑得太快、条带模糊;大片段用高浓度胶跑不动【7】【8】。
杭州富沃克生物科技有限公司提供多款DNA Marker成品——即开即用,条带清晰【9】【10】:

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[1] Yingxinbio. DL2000 DNA Marker产品说明.
[2] Qiyunbio. DL 2000 DNA marker产品说明.
[3] BioWORLD. DNA Marker (100bp-1kb) Product Information.
[4] Biomart. 100bp DNA Marker产品介绍. 2023.
[5] Biomart. DNA分子量标准Marker (100~5000 bp)产品介绍. 2025.
[6] Biomart. DNA Marker(50~1500bp)产品说明.
[7] 百度百科. DNA分子质量标准物.
[8] 生工. DNA分子量标准Marker B(100~600 bp)产品说明.
[9] 杭州富沃克生物科技有限公司. 三色预染DNA Marker产品介绍(DNA606).
[10] 杭州富沃克生物科技有限公司. 高清晰低拖尾DNA Marker产品介绍.
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