琼脂糖凝胶 – 核酸电泳用凝胶配制
用途说明
用于DNA片段的琼脂糖凝胶电泳分离、检测及回收,是分子生物学中最基础的核酸分析手段。
配制方法与操作流程
缓冲液准备:配制适量电泳及制胶用缓冲液(常用0.5×TBE或1×TAE)。制胶与电泳必须使用同一缓冲液。
称量琼脂糖:根据制胶量及目标凝胶浓度,准确称取琼脂糖粉,置于合适的锥形瓶中。
加缓冲液:加入计算好的电泳缓冲液量(总液体量不应超过锥形瓶容积的50%,以防沸腾溢出)。
微波炉加热熔化:
瓶口封保鲜膜并扎数个小孔(防止爆沸及水分过度蒸发)。
微波炉加热至沸腾后取出,戴防热手套小心摇匀,重复数次至琼脂糖完全熔化、无透明颗粒。
关键:每次沸腾即停,避免过热暴沸导致浓度不准及微波炉污染;必须完全熔化,否则电泳条带模糊。
冷却与加染料:溶液自然冷却至约60℃(手触瓶壁不烫为宜),如需加入溴乙锭(EB)至终浓度0.5μg/ml,充分混匀。(溴乙锭为强致癌物,操作须戴手套)
制胶:将琼脂糖溶液倒入制胶模具,插入合适齿数的梳子,凝胶厚度通常3~5mm。
凝固与电泳:室温静置约30分钟~1小时至完全凝固,小心拔出梳子,将凝胶置入电泳槽中,加入缓冲液没过凝胶即可上样电泳。
琼脂糖凝胶浓度与线形DNA最佳分辨范围
| 琼脂糖浓度 | 最佳线形DNA分辨范围(bp) |
|---|---|
| 0.5% | 1,000~30,000 |
| 0.7% | 800~12,000 |
| 1.0% | 500~10,000 |
| 1.2% | 400~7,000 |
| 1.5% | 200~3,000 |
| 2.0% | 50~2,000 |
关键操作要点
缓冲液统一:制胶与电泳必须使用同一批次、同一浓度的缓冲液,否则会导致电泳时离子强度不一致,条带扭曲。
未使用凝胶保存:凝胶若不立即使用,应以保鲜膜包好,4℃保存,一般可存放2~5天(避免干燥及污染)。
EB安全操作:含EB的凝胶及缓冲液均按致癌物废弃物处理,操作全程戴双层手套,专用器具。
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