考马斯亮蓝R-250染色液是SDS-PAGE蛋白电泳后检测凝胶中蛋白质条带最经典、最常用的染色方法。考马斯亮蓝R-250通过静电作用和疏水作用与蛋白质结合,形成蓝色复合物,染色灵敏度可达0.1~1μg蛋白条带。适用于SDS-PAGE凝胶、非变性PAGE凝胶及等电聚焦凝胶的蛋白质染色检测,是蛋白纯化分析、Western blot质控和蛋白表达检测的基础染色方法。
0.1%(W/V)考马斯亮蓝R-250 – 蛋白质结合染料
25%(V/V)异丙醇 – 作为溶剂及蛋白固定剂
10%(V/V)冰醋酸 – 酸性介质,促进染料与蛋白结合
称取 1g 考马斯亮蓝R-250,置于1L烧杯中。
量取 250ml 异丙醇,加入烧杯中,磁力搅拌至染料完全溶解(搅拌约15~30分钟)。
加入 100ml 冰醋酸,搅拌均匀。
加入 650ml 去离子水,继续搅拌至充分混匀。
用滤纸(定性滤纸或滤膜)过滤去除未溶解的颗粒物质。
转移至试剂瓶中,室温密封保存。
| 组分 | 功能 | 关键说明 |
|---|---|---|
| 考马斯亮蓝R-250 | 蛋白质特异性结合染料 | 与蛋白碱性氨基酸(精氨酸、赖氨酸)和疏水区域结合呈蓝色 |
| 异丙醇 | 溶剂兼蛋白固定剂 | 促进染料溶解,同时沉淀固定凝胶中的蛋白质,防止扩散 |
| 冰醋酸 | 酸性介质 | 提供酸性pH环境,增强染料与蛋白质的结合效率 |
电泳结束后,将凝胶剥离并置于染色容器中。
加入足量染色液(至少完全覆盖凝胶),室温摇床轻摇染色2~4小时(或过夜)。
染色结束后回收染色液(可重复使用2~3次)。
加入考马斯亮蓝脱色液(10%冰醋酸,5%乙醇),脱色至背景清晰透明,蛋白条带呈深蓝色即可。
脱色液需更换2~3次以加速脱色。
考马斯亮蓝R-250分子中的磺酸基团与蛋白质碱性氨基酸(尤其是精氨酸)的阳离子位点通过静电作用结合,同时染料的疏水芳香环与蛋白质的疏水区域通过疏水相互作用结合,形成稳定的蓝色复合物。异丙醇可使蛋白质沉淀固定于凝胶中,冰醋酸提供酸性环境增强染料结合力。
充分溶解:考马斯亮蓝R-250在异丙醇中溶解较慢,需充分搅拌至完全溶解(溶液呈深蓝色透明状)后再加水稀释。
过滤除颗粒:未完全溶解的染料颗粒会导致染色背景不均匀,必须用滤纸过滤去除颗粒物质。
染色时间:染色2~4小时通常足以使蛋白条带充分显色。若蛋白量较低(<0.1μg),建议过夜染色以提高灵敏度。
染色液可回收:染色液可重复使用2~3次,但随使用次数增加染色效率会下降。使用前若出现沉淀需重新过滤。
废液处置(重要):染色液含有异丙醇和冰醋酸,属于危险有机废液,严禁直接倒入下水道,必须倒入专门的有机溶剂废液桶,按实验室危险废物标准统一处理。
容器选择:建议使用玻璃或聚丙烯容器盛装染色液,避免与某些塑料发生反应。
| 问题现象 | 可能原因 | 解决方法 |
|---|---|---|
| 染色后背景色深 | 染色时间过长或染料浓度过高 | 延长脱色时间,多次更换脱色液 |
| 染色不均匀 | 摇动速度不够或染料未完全溶解 | 增加摇床转速,重新过滤染色液 |
| 蛋白条带很浅 | 蛋白上样量太少 | 增加蛋白上样量或延长染色时间 |
| 凝胶背景有黑点 | 染料颗粒污染 | 染色前用滤纸过滤染色液 |
考马斯亮蓝脱色液 – 10%冰醋酸、5%乙醇配制
考马斯亮蓝G-250染色液 – 蛋白溶液定量用Bradford法
硝酸银染色试剂盒 – 灵敏度更高(ng级)的蛋白染色替代方案
SDS-PAGE预制胶 – 即用型蛋白电泳凝胶
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